作者: Chinta Sidharthani博士,Lily Ramsey, llm 2024年9月18日
修饰核苷酸的应用,如N1-methylpseudouridine (N1Mψ),在信使RNA (mRNA) 疫苗中能够有效减轻全身炎症反应,从而提升疫苗的效果。然而,mRNA疫苗的短半衰期和潜在的不良反应等问题仍然影响其疗效。
最近,波士顿大学的科学家们在《自然生物技术》期刊上发表了一项研究,探讨了在自我扩增RNA中使用修饰核苷酸是否能够克服mRNA疫苗的缺陷,并有效预防严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 的感染。
研究表明,使用修饰核苷酸的自我扩增RNA能够有效抑制干扰素反应,减轻鼻塞并增强疫苗效力。图片来源: KomootP/Shutterstock.com
背景
化学修饰的核苷酸已被广泛应用于mRNA疫苗中,以提高其细胞内的传递效率,增强mRNA分子的稳定性,并降低炎症免疫反应。这些修饰的核苷酸在开发针对2019冠状病毒病(COVID-19)的mRNA疫苗时发挥了重要作用。
与普通RNA相比,N1mΨ的使用能够有效防止toll样受体及其他免疫传感器的激活,从而提升疫苗的有效性。然而,由于mRNA疫苗的半衰期较短,通常需要更大且更频繁的剂量,这也增加了不良反应的风险。
自我扩增RNA(saRNA)能够在体内自我复制,少量剂量即可产生大量蛋白质,因此被视为mRNA的理想替代品。然而,saRNA可能引发早期免疫反应,从而降低其疫苗效力。
尽管在saRNA中使用化学修饰的核苷酸可能是一个潜在的解决方案,但这一方法尚未得到有效验证。
研究概述
本研究中,研究人员探讨了在saRNA构建体中使用不同修饰的核苷酸,以改善蛋白质表达和转染效率,从而增强基因治疗和疫苗的效果。
研究团队合成了一个saRNA构建文库,通过体外转录替换了修饰的核苷酸5-甲基尿嘧啶(m5U)、5-甲基胞苷(m5C)和5-羟甲基胞苷(hm5C),并将报告蛋白编码到saRNA中。
随后,研究人员比较了hm5C和m5C修饰的saRNA与未修饰的saRNA及N1mΨ修饰的mRNA在HEK293T细胞中的转染效率。
采用阳离子脂质转染法,将带正电的脂质与saRNA结合,以促进其进入细胞并评估转染效果。
此外,saRNA还被装载到脂质纳米颗粒中,并转染到多种细胞类型,包括永生化的人T淋巴细胞Jurkat细胞和小鼠成肌细胞C2C12细胞。
在体外转录后,采用纤维素层析纯化RNA制剂,以去除双链RNA杂质,降低不良免疫反应。
通过用装载saRNA构建物的脂质纳米颗粒培养外周血单核细胞,研究了修饰和未修饰的saRNA对免疫系统的影响。
免疫应答通过分析细胞因子和干扰素相关基因的表达,特别是干扰素α和干扰素β的表达来评估。此外,使用小鼠模型进行了体内实验,脂质纳米颗粒包裹的saRNA通过肌肉注射给小鼠。
saRNA结构中编码了萤火虫荧光素酶基因,使得可以通过生物发光成像实时监测蛋白质的表达。同时,定期分析小鼠的血清样本以测量干扰素水平并评估全身免疫反应。
研究还测试了编码SARS-CoV-2刺突蛋白基因的saRNA构建体的剂量反应。使用不同剂量的saRNA疫苗的小鼠在遭受致命的SARS-CoV-2变体攻击后,通过测量血液中中和抗体的水平来评估疫苗的效果。
主要发现
研究结果显示,含有hm5C和m5C的修饰saRNA的转染效率显著高于标准的未修饰saRNA构建体。在HEK293T细胞中,含有m5C的saRNA的蛋白表达水平比未修饰的saRNA高出4.9倍,比N1mΨ修饰的mRNA高出68倍。
转染后,m5C修饰的saRNA表达稳定,持续时间可达一周。m5C修饰的saRNA在三种细胞系中的蛋白表达均明显优于未修饰的saRNA和N1mΨ修饰的mRNA。
体内实验结果表明,与未修饰的saRNA相比,m5C修饰的saRNA在28天内保持稳定的蛋白表达,并且炎症免疫反应显著降低。
即使在低剂量下,m5C修饰的SARS-CoV-2 saRNA疫苗也能显著提高小鼠的存活率,其诱导的中和抗体滴度明显高于未修饰的saRNA和N1mΨ修饰的mRNA。
结论
总体而言,研究表明在saRNA构建体中使用化学修饰的核苷酸m5C显著提升了转染效率和蛋白表达。此外,使用m5C修饰的saRNA编码SARS-CoV-2刺突蛋白作为疫苗,相较于未修饰的saRNA,具有更高的存活率和更低的炎症反应。
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